الانتقال الى المحتوى الأساسي
23-جمادى الآخرة-1447 هـ
جامعة الملك عبدالعزيز
KING ABDULAZIZ UNIVERSITY
معهد الجينوم الطبي
تفاصيل الوثيقة
نوع الوثيقة
:
مقال في مجلة دورية
عنوان الوثيقة
:
STRait Razor v2s: Advancing sequence-based STR allele reporting and beyond to other marker systems
STRait Razor v2s: Advancing sequence-based STR allele reporting and beyond to other marker systems
لغة الوثيقة
:
الانجليزية
المستخلص
:
STRait Razor has provided the forensic community a free-to-use, open-source tool for short tandem repeat (STR) analysis of massively parallel sequencing (MPS) data. STRait Razor v2s (SRv2s) allows users to capture physically phased haplotypes within the full amplicon of both commercial (ForenSeq) and “early access” panels (PowerSeq, Mixture ID). STRait Razor v2s may be run in batch mode to facilitate population-level analysis and is supported by all Unix distributions (including MAC OS). Data are reported in tables in string (haplotype), length-based (e.g., vWA allele 14), and International Society of Forensic Genetics (ISFG)-recommended (vWA [CE 14]-GRCh38-chr12:5983950-5984049 (TAGA)10 (CAGA)3 TAGA) formats. STRait Razor v2s currently contains a database of 2500 unique sequences. This database is used by SRv2s to match strings to the appropriate allele in ISFG-recommended format. In addition to STRs, SRv2s has configuration files necessary to capture and report haplotypes from all marker types included in these multiplexes (e.g., SNPs, InDels, and microhaplotypes). To facilitate mixture interpretation, data may be displayed from all markers in a format similar to that of electropherograms displayed by traditional forensic software. The download package for SRv2s may be found at https://www.unthsc.edu/graduate-school-of-biomedical-sciences/molecular-and-medical-ge- netics/laboratory-faculty-and-staff/strait-razor.
ردمد
:
1872-4973
اسم الدورية
:
Forensic Science International: Genetics
المجلد
:
29
العدد
:
1
سنة النشر
:
1438 هـ
2017 م
نوع المقالة
:
مقالة علمية
تاريخ الاضافة على الموقع
:
Thursday, June 1, 2017
الباحثون
اسم الباحث (عربي)
اسم الباحث (انجليزي)
نوع الباحث
المرتبة العلمية
البريد الالكتروني
King Jonathan L
Jonathan L, King
باحث رئيسي
دكتوراه
Wendt Frank R
Frank R, Wendt
باحث
دكتوراه
Sun Jie
Jie, Sun
باحث
دكتوراه
Budowle Bruce
Bruce, Budowle
باحث
دكتوراه
الملفات
اسم الملف
النوع
الوصف
40840.pdf
pdf
الرجوع إلى صفحة الأبحاث