الانتقال الى المحتوى الأساسي
23-جمادى الآخرة-1447 هـ
جامعة الملك عبدالعزيز
KING ABDULAZIZ UNIVERSITY
معهد الجينوم الطبي
تفاصيل الوثيقة
نوع الوثيقة
:
مقال في مجلة دورية
عنوان الوثيقة
:
Fast STR allele identification with STRait Razor 3.0
Fast STR allele identification with STRait Razor 3.0
لغة الوثيقة
:
الانجليزية
المستخلص
:
The short tandem repeat allele identification tool (STRait Razor), a program used to characterize the haplotypes of short tandem repeats (STRs) in massively parallel sequencing (MPS) data, was redesigned. STRait Razor v3.0 performs ∼660× faster allele identification than its previous version (v2s), a speedup that is largely due to a novel indexing strategy used to perform "fuzzy" (approximate) string matching of anchor sequences. Written in a portable compiled language, C++, STRait Razor v3.0 functions on all major operating systems including Microsoft Windows, and it has cross-platform multithreading support. In silico estimates of precision and accuracy of STRait Razor v3.0 were 100% in this evaluation and results were highly concordant with those of Strait Razor v2s. STRait Razor v3.0 adds several key features that simplify the haplotype reporting process, including simple filters to remove low frequency haplotypes as well as merging haplotypes within a locus encoded on opposite strands of the DNA molecule.
ردمد
:
1872-4973
اسم الدورية
:
Forensic Science International: Genetics
المجلد
:
30
العدد
:
1
سنة النشر
:
1438 هـ
2017 م
نوع المقالة
:
مقالة علمية
تاريخ الاضافة على الموقع
:
Wednesday, June 26, 2019
الباحثون
اسم الباحث (عربي)
اسم الباحث (انجليزي)
نوع الباحث
المرتبة العلمية
البريد الالكتروني
August E. Woerner
Woerner, August E.
باحث رئيسي
دكتوراه
August.Woerner@unthsc.edu
Jonathan L. King
King, Jonathan L.
باحث
دكتوراه
Bruce Budowle
Budowle, Bruce
باحث
دكتوراه
الملفات
اسم الملف
النوع
الوصف
44538.pdf
pdf
الرجوع إلى صفحة الأبحاث